#Python

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Python 是一种用于通用编程的解释性高级编程语言。Python 由 Guido van Rossum 创建并于 1991 年首次发布,其设计理念强调代码的可读性,特别是使用大量的空白

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InterSystems Python 绑定

文章 Lilian Huang · 十一月 6 6m read

我很清楚对于那些完全不熟悉 VS Code、Git、Docker、FHIR 和其他工具的人来说,设置环境时会遇到一些困难。 所以我决定写这篇文章,详细介绍整个设置过程,以便大家能够轻松上手。

如果您能在本文最后留下评论,告诉我说明是否清楚,是否有遗漏,或者是否有其他您觉得有用的东西,我将不胜感激。

设置包括:

✅ VS Code – 代码编辑器
✅ Git – 版本控制系统
✅ Docker – 运行 IRIS for Health Community 的实例
✅ VS Code REST 客户端扩展程序 – 用于运行 FHIR API 查询
✅ Python – 用于编写基于 FHIR 的脚本
✅ Jupyter Notebook – 用于 AI 和 FHIR 任务

准备工作:确保您在系统上拥有管理员权限

除了阅读本指南,您还可以按照视频中的步骤操作:

如果您是 Windows 系统(请注意:原文是YouTube视频,请跳转至EN原帖查看)

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文章 Lilian Huang · 十一月 6 7m read

Interoperability on Python (IoP) 是一个概念验证项目,旨在展示与 Python 优先方式相结合时 InterSystems IRIS Interoperability Framework 的强大功能。IoP 利用Embedded Python(嵌入式 Python,InterSystems IRIS 的一个功能)使开发者能够用 Python 编写互操作性组件,从而可以与强大的 IRIS 平台无缝集成。本指南专为初学者编写,全面介绍了 IoP、其设置以及创建第一个互操作性组件的操作步骤。 阅读完本文,您将能够清楚地了解如何使用 IoP 构建可扩缩、基于 Python 的互操作性解决方案。

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文章 Lilian Huang · 十月 24 14m read

学习如何使用 LangGraph 设计结合了推理、矢量搜索和工具集成的可扩缩自主 AI 智能体。

概括

  • AI 智能体是一种超越简单的聊天机器人的自主系统,它结合了记忆库、上下文,并具有自动完成任务的主动性。
  • LangGraph 是一种框架,它使我们能够利用具有内置状态管理的节点(任务)和边缘(连接),构建复杂的 AI 工作流。
  • 本指南将指导您构建 AI 赋能的客户支持智能体,该智能体可以划分优先级,识别相关主题,并确定是上报还是自动回复。

那么,AI 智能体究竟是什么?

让我们直面它吧 —“AI 智能体”听起来就像可以接管会议室的机器人。 实际上,它们是您得力的助手,可以简化复杂的工作流,消除重复性任务。 您可以把它们看作是聊天机器人的下一个进化阶段:它们不只是简单地等待提示;它们可以发起行动,协调多个步骤,并随时进行调整。

过去,打造一个“智能”系统意味着兼顾语言理解、代码生成、数据查找等各种不同的模型,然后将它们粘合在一起。 您的一半时间花在了集成上,另一半时间则花在了调试上。

智能体彻底颠覆了这一切。 它们将上下文、主动性和适应性融合在一个精心编排的流程中。 它们不仅实现了自动化,更是肩负使命的智者。 借助 LangGraph 之类的框架,我相信,组建一支自己的智能体团队实际上会很有趣。

LangGraph 究竟是什么?

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文章 Lilian Huang · 九月 19 5m read

您知道当您拿到验血结果时一切看起来都像天书的那种感觉吗? 这就是 FHIRInsight 要解决的问题。 它最初的理念是,医疗数据不应该令人恐惧或困惑 – 它应该是我们所有人都能使用的东西。 验血是健康检查中十分常见的检查,但说实话,大多数人都很难理解它们,有时甚至对不擅长实验室工作的医务人员来说也是如此。 FHIRInsight 希望整个过程能够变得更简单,信息更富有实用价值。

🤖我们为什么要构建 FHIRInsight

这一切都始于一个简单而有力的问题:

“为什么验血结果仍然很难读懂 — 有时甚至对医生来说也是如此?”

如果您看过化验结果,您可能会看到一大堆数字、隐晦的缩写和“参考范围”,这些可能适用于您的年龄、性别或身体状况,也可能不适用。 毫无疑问,它是一种诊断工具,但如果没有背景信息,它就变成了一个猜谜游戏。 即使是经验丰富的医疗保健专业人员有时也需要交叉参考指导方针、研究论文或专家意见才能理解所有内容。

这正是 FHIRInsight 的用武之地。

我们不只是为患者而构建,也为一线医护人员而构建。 为轮流值班的医生,为捕捉生命体征细微变化的护士,为每一位试图在有限的时间和巨大的责任下做出正确决定的医护人员而构建。 我们的目标是让他们的工作简单一点,将密集的临床 FHIR 数据转化为清晰、有用、以真正的医学科学为基础的东西, 讲人类语言的东西。

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文章 Lilian Huang · 四月 16 7m read

Hi 大家好
在本文中,我讲介绍我的应用 iris-AgenticAI .

代理式人工智能的兴起标志着人工智能与世界互动方式的变革性飞跃--从静态响应转变为动态、目标驱动的问题解决方式。参看 OpenAI’s Agentic SDK ,  OpenAI Agents SDK使您能够在一个轻量级、易用且抽象程度极低的软件包中构建代理人工智能应用程序。它是我们之前的代理实验 Swarm 的生产就绪升级版。

该应用展示了下一代自主人工智能系统,这些系统能够进行推理、协作,并以类似人类的适应能力执行复杂任务。

应用功能

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公告 Claire Zheng · 九月 11, 2024

HI 各位开发者们,

📅2024年9月23日🕑14:00-15:30🕞,InterSystems将举办线上研讨会,点击🔔此处🔔报名参会。

此次研讨会以“面向未来的数据平台——InterSystems IRIS五大亮点提速数据潜力挖掘与AI应用”为主题,帮助您了解InterSystems IRIS数据平台的五大亮点:

  • 使用InterSystems IRIS for Health进行FHIR开发
  • 使用Python进行互操作Production开发
  • InterSystems IRIS列存储
  • InterSystems IRIS外部表(Foreign Table)
  • InterSystems IRIS向量和基于向量检索的患者相似度匹配
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文章 Louis Lu · 七月 1, 2024 2m read

在 OEX 最近一次编程竞赛之后,我有一些令人惊讶的发现。
几乎所有的应用程序都是基于人工智能与预制 Python 模块的结合。
但深入研究后发现,所有示例都使用了 IRIS 的相同技术组件。

从 IRIS 的角度来看,无论是搜索文本还是搜索图像或其他模式都是一样的。 其底层基本都是一样的。

          这让我想起了我家里的情况。我的妻子和女儿对家里的大量裙子、衬衫和其他衣服的信息进行了整理。
          但无论如何进行整理、分类、归档,我依然通过和我的妻子和女儿说话,来确定我的穿着。
           无论怎样包装,其结果都是如此。

回到这次竞赛比赛:
同样的 IRIS 技术内容,却有很多花哨的包装。
每个人都在同一条高速公路上奔跑。没有人提到它有什么限制。

于是我试着深入挖掘,找出新数据类型 VECTOR 的使用限制。
所有向量都有两个基本参数
  - 静态 DATATYPE:"整型integer"(或 "int")、"double"、"十进制decimal"、"字符串 "和 "时间戳"。
  - 半动态 LEN(gth): > 0 通常也称为 POSITION;纯整数。

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文章 Louis Lu · 六月 11, 2024 8m read

这篇文章介绍了使用由支持 langchain 框架的IRIS来实现问答聊天机器人,其重点介绍了检索增强生成(RAG)。

文章探讨了IRIS中的向量搜索如何在langchain-iris中完成数据的存储、检索和语义搜索,从而实现对用户查询的精确、快速的响应。通过无缝集成以及索引和检索/生成等流程,由IRIS驱动的RAG应用程序使InterSystems开发者能够利用GenAI系统的能力。

为了帮助读者巩固这些概念,文章提供了Jupyter notebook一个完整的问答聊天机器人应用程序,以供参考。

什么是RAG以及它在问答聊天机器人中的角色

RAG,即检索增强生成,是一种通过整合超出初始训练集的补充数据来丰富语言模型(LLM)知识库的技术。尽管LLM在跨不同主题进行推理方面具有能力,但它们仅限于在特定截止日期之前训练的公共数据。为了使AI应用程序能够有效处理私有或更近期的数据,RAG通过按需补充特定信息来增强模型的知识。这是一种替代微调LLM的方法,微调可能会很昂贵。

在问答聊天机器人领域,RAG在处理非结构化数据查询中发挥着关键作用,包括两个主要组成部分:索引和检索/生成。

索引从数据源摄取数据开始,然后将其分割成更小、更易于管理的块以进行高效处理。这些分割的块随后被存储和索引,通常使用嵌入模型和向量数据库,确保在运行时能够快速准确地检索。

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文章 Michael Lei · 三月 21, 2024 2m read

这是在 IRIS 中完全运行向量搜索演示的尝试。
没有外部工具,您需要的只是终端/控制台和管理门户。
特别感谢Alvin Ryanputra作为他的软件包iris-vector-search的基础
灵感和测试数据的来源。
我的软件包基于 IRIS 2024.1 版本,需要注意您的处理器功能。

我尝试用纯 ObjectScript 编写演示。
仅描述向量的计算是在嵌入式Python中完成的
计算 2247 个记录的 384 维向量需要时间。
在我的 Docker 容器中,它正在运行 01:53:14 来完全生成它们。

然后被警告了!
所以我将这一步调整为可重入,以允许暂停向量计算。
每 50 条记录,您就会收到一次停止的提议。
该演示如下所示:

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文章 Michael Lei · 二月 18, 2024 11m read

1. IRIS RAG Demo

这是 IRIS 与 RAG(检索增强生成)示例的一个简单演示。 后端是使用 IRIS 和 IoP用 Python 编写的,LLM 模型是 orca-mini 并由 ollama 服务器提供。 前端是用 Streamlit 编写的聊天机器人。

    1. IRIS RAG 演示](#1-iris-rag-demo)
    • 1.1. 什么是 RAG](#11-what-is-rag)
    • 1.2. 如何工作?
    • 1.3. 安装演示](#13-installation-the-demo)
    • 1.4. 使用方法
    • 1.5. 演示如何运行](#15-演示如何运行)
      • [1.5.1. 前端](#151-前端)
      • 1.5.2. 后台
        • [1.5.2.1. 业务服务](#1521-业务服务)
        • [1.5.2.2. 业务流程](#1522-业务流程)
        • [1.5.2.3. LLM 操作](#1523-the-llm-operation)
        • 1.5.2.4. 矢量操作](#1524-the-vector-operation)
    • 1.6. 一般性说明](#16-一般性说明)

1.1. 什么是 RAG?

RAG 是 Retrieval Augmented Generation(检索增强生成)的缩写,它带来了使用带有知识库的 LLM 模型(GPT-3.5/4、Mistral、Orca 等)的能力。

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文章 Jingwei Wang · 二月 15, 2024 4m read

大型语言模型(例如 OpenAI 的 GPT-4)的发明和普及掀起了一波创新解决方案浪潮,这些解决方案可以利用大量非结构化数据,在此之前,人工处理这些数据是不切实际的,甚至是不可能的。此类应用程序可能包括数据检索(请参阅 Don Woodlock 的 ML301 课程,了解检索增强生成的精彩介绍)、情感分析,甚至完全自主的 AI 代理等!

在本文中,我想演示如何使用 IRIS 的嵌入式 Python 功能直接与 Python OpenAI 库交互,方法是构建一个简单的数据标记应用程序,该应用程序将自动为我们插入IRIS 表中的记录分配关键字。然后,这些关键字可用于搜索和分类数据,以及用于数据分析目的。我将使用客户对产品的评论作为示例用例。

先决条件

  • 运行的IRIS实例
  • OpenAI API 密钥(您可以在此处创建)
  • 配置好的开发环境(本文将使用VS Code

Review类

让我们首先创建一个 ObjectScript 类,该类将定义客户评论的数据模型。为了简单起见,我们将只定义 4 个 %String 字段:客户姓名、产品名称、评论正文以及我们将生成的关键字。该类应该扩展%Persistent,以便我们可以将其对象保存到磁盘。

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文章 Michael Lei · 九月 18, 2023 6m read

如今,关于大语言模型、人工智能等的消息不绝于耳。向量数据库是其中的一部分,并且已经有非IRIS的技术实现了向量数据库。

为什么是向量?

  • 相似性搜索:向量可以进行高效的相似性搜索,例如在数据集中查找最相似的项目或文档。传统的关系数据库是为精确匹配搜索而设计的,不适合图像或文本相似性搜索等任务。
  • 灵活性:向量表示形式用途广泛,可以从各种数据类型派生,例如文本(通过 Word2Vec、BERT 等嵌入)、图像(通过深度学习模型)等。
  • 跨模态搜索:向量可以跨不同数据模态进行搜索。例如,给定图像的向量表示,人们可以在多模式数据库中搜索相似的图像或相关文本。

还有许多其他原因。

因此,对于这次 pyhon 竞赛,我决定尝试实现这种支持。不幸的是我没能及时完成它,下面我将解释原因。

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文章 Michael Lei · 九月 17, 2023 2m read

增强的密码管理:无缝编辑密码

在不断发展的数字安全领域,强大的密码管理工具已变得不可或缺。我们的密码管理应用程序旨在简化和保护您的在线生活,现在提供了一项增强功能 - 轻松编辑密码的能力。

为什么这个功能会改变游戏规则?

  1. 灵活性:生活是动态的,我们的在线帐户也是如此。借助新的编辑密码功能,您可以在需要时灵活地修改已保存的密码。无论您是出于安全考虑想要更改密码还是只是更新密码,此功能都可以让您轻松适应。
  2. 简化的体验:编辑密码是无缝且用户友好的。不再需要繁琐的过程或从头开始创建新条目。只需点击几下,您的密码就会更新,从而使您的记录保持井然有序且最新。
  3. 增强安全性:我们将安全性放在首位。编辑密码功能可确保使用现有加密密钥对更新后的密码进行加密。这意味着即使修改密码,您的数据仍然受到保护。
  4. 个性化:您的密码,您做主。根据需要自定义标题、登录名和密码。此功能使您能够使您的密码管理器真正个性化,适合您独特的偏好和组织风格。

怎么运行的:

  • 登录到您的帐户。
  • 导航到您要编辑的密码。
  • 单击“编辑”图标。
  • 修改密码标题、登录名或密码本身。
  • 保存您的更改。
  • 您更新的密码现已安全存储并可供使用。

保持安全,保持井井有条:

凭借增强的编辑密码功能,我们的密码管理器为您的安全需求提供了更全面的解决方案。确保安全、井井有条并放心地管理您的密码。

下一步是什么:

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文章 Kelly Huang · 九月 3, 2023 7m read

对于即将到来的Python 竞赛,我想制作一个小型演示,介绍如何使用 Python 创建一个简单的 REST 应用程序,该应用程序将使用 IRIS 作为数据库。使用这个工具

  • FastAPI框架,高性能,易学,快速编码,可用于生产
  • SQLAlchemy 是 Python SQL 工具包和对象关系映射器,为应用程序开发人员提供 SQL 的全部功能和灵活性
  • Alembic 是一个轻量级数据库迁移工具,可与 SQLAlchemy Database Toolkit for Python 一起使用。
  • Uvicorn 是 Python 的 ASGI Web 服务器实现。
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文章 Jingwei Wang · 八月 30, 2023 5m read

案例描述

假设您是一名 Python 开发人员或拥有一支训练有素的 Python 专业团队,但您分析 IRIS 中某些数据的期限很紧迫。当然,InterSystems 提供了许多用于各种分析和处理的工具。然而,在给定的场景中,最好使用旧的 Pandas 来完成工作,然后将 IRIS 留到下次使用。
对于上述情况和许多其他情况,您可能需要从 IRIS 获取表来管理 InterSystems 产品之外的数据。但是,当您有任何格式(即 CSV、TXT 或 Pickle)的外部表时,您可能还需要以相反的方式执行操作,您需要在其上导入并使用 IRIS 工具。
无论您是否必须处理上述问题,Innovatium让我明白,了解更多解决编码问题的方法总是能派上用场。好消息是,从 IRIS 引入表时,您不需要经历创建新表、传输所有行以及调整每种类型的繁琐过程。
本文将向您展示如何通过几行代码快速将 IRIS 表转换为 Pandas 数据框架并向后转换。您可以在我的GitHub上查看代码,您可以在其中找到包含本教程每个步骤的 Jupiter Notebook。

从 IRIS 引入一张Table

当然,您应该首先导入该项目所需的库。

import pandas as pd import sqlalchemy as db
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文章 Weiwei Gu · 八月 4, 2023 3m read

InterSystems IRIS 目前将类限制为 999 个属性。

但是,如果您需要为每个对象存储更多数据该怎么办?

本文将回答这个问题(附加了社区 Python 网关的客串以及如何将广泛的数据集传输到 Python 中)。

答案其实很简单 - InterSystems IRIS 目前将类限制为 999 个属性,但不限制 999 个基元(primitives)。 InterSystems IRIS 中的属性可以是具有 999 个属性的对象等等 - 该限制很容易被忽略。

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文章 Kelly Huang · 七月 12, 2023 4m read

FHIR 通过提供标准化数据模型来构建医疗保健应用程序并促进不同医疗保健系统之间的数据交换,彻底改变了医疗保健行业。由于 FHIR 标准基于现代 API 驱动的方法,因此移动和 Web 开发人员更容易使用它。然而,与 FHIR API 交互仍然具有挑战性,尤其是在使用自然语言查询数据时。

隆重推出FHIR - AI 和 OpenAPI 链应用程序,该解决方案允许用户使用自然语言查询与 FHIR API 进行交互。该应用程序使用OpenAILangChainStreamlit构建,简化了查询 FHIR API 的过程并使其更加用户友好。

 

FHIR OpenAPI 规范是什么?

OpenAPI 规范(以前称为 Swagger,目前是OpenAPI Initiative的一部分)已成为软件开发领域的重要工具,使开发人员能够更有效地设计、记录 API 并与 API 交互。 OpenAPI 规范定义了一种标准的机器可读格式来描述 RESTful API,提供了一种清晰一致的方式来理解其功能并有效地使用它们。

在医疗保健领域,FHIR 成为数据交换和互操作性的领先标准。为了增强FHIR的互操作能力, HL7正式记录了FHIR OpenAPI规范,使开发人员能够将FHIR资源和操作无缝集成到他们的软件解决方案中。

 

FHIR OpenAPI 规范的优点:

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文章 Michael Lei · 六月 14, 2023 3m read

本文是 SqlDatabaseChain 的简单快速入门(我所做的)。

希望大家会感兴趣。

非常感谢:

sqlalchemy-iris 作者@Dmitry Maslennikov

您的项目使我的试验变得可能。

文章脚本使用 openai API,因此请注意不要在外部共享您不打算共享的表信息和记录。

如果需要,可以插入本地模型。

创建一个新的虚拟环境

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文章 Hao Ma · 三月 14, 2023 2m read

介绍

在最近几篇文章中的一些文章中,我谈到了 IRIS 和 Python 之间的类型,很明显,从一侧到另一侧访问对象并不是那么容易。

幸运的是,已经完成了创建SQLAlchemy-iris 的工作(点击链接在 Open Exchange 上查看它),这使得 Python 访问 IRIS 对象的一切变得更加容易,我将展示它的启动器。

谢谢@Dmitry Maslennikov

安装中

要安装,只需打开具有管理员权限的终端并输入

pip install sqlalchemy-iris

如果需要,这还将为您安装先决条件。

用法

现在,在 python 文件上,您可以导入模块、连接到数据库并以任何您想要的方式使用 sqlalchemy。如果你觉得舒服,你可以按照以下步骤操作:

  • 从 sqlalchemy 导入“create_engine”并使用字符串“iris://username:password@IP:port/namespace”创建引擎。当然,您可以导入整个模块,但“create_engine”会创建一个 Engine 实例(sqlalchemy.engine,有关更多信息,请单击此处)具有我在这里展示的所有必要子类。
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文章 Michael Lei · 三月 10, 2023 3m read

InterSystems IRIS 2022.2 具有适用于 Python 的原生 SDK (https://docs.intersystems.com/iris20222/csp/docbook/Doc.View.cls?KEY=PA…)。

我们知道如何使用 IRIS Object Script $Order 函数遍历Global数据结构。

SET key= ""FOR { SET key= $ORDER ( ^myglobal (key)) QUIT :key= ""WRITE !, ^myglobal (key) }

如何使用 IRIS Native SDK 从 Python 执行相同的操作?这里有一个代码示例:

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文章 Michael Lei · 三月 2, 2023 4m read

在这里,您将找到一个在 IRIS 环境中使用 Python 的简单程序,以及另一个在 Python 环境中使用 ObjectScript 的简单程序。另外,我想分享一些我在学习实践时遇到的麻烦。

IRIS 环境中的 Python

比方说,您在 IRIS 环境中想要解决一个您认为使用 Python 更容易或更有效的问题。

您可以简单地更改环境:像创建任何其他方法一样创建您的方法,并在其名称和规范的末尾添加 [Language = python]:

您可以在该方法中使用任何类型的参数,并且要访问它们,您可以执行与在 COS 中完全相同的操作:

假设您有这个 %String 参数 Arg 和一个来自自定义类的参数 OtherArg。这个其他类可能具有标题和作者等属性。您希望像这样访问:

此方法提供如下输出:

而且,对于访问类方法,它几乎是一样的。假设我们在 Demo.Books.PD.Books 中有一个名为“CreateString”的方法,它将标题和作者连接成类似于“Title: <Title>; Author: <Author>”的内容。

将其添加到我们的 python 方法的末尾:

将提供以下输出:

(要访问该方法,您可以使用 OtherArg.CreateString(),但我选择将 OtherArg 中的相同值传递给 CreateString 方法,以便输出看起来相似并且代码看起来更简单)

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问题 Shuai Wang · 二月 15, 2023

您好,我们的客户仍在使用较旧的 cache 2016.1 版本,我们这边需要适配 python 作为 client 连接 cache 进行一些操作。 但是查阅相关文档后发现,需要自行编译安装 python 驱动。

我们手头上只有 windows 版本的 cache 安装包,但是我们python适配的环境是 linux。 所以我想找一下是否有 cache 现有的 python 安装包或者 cache linux 安装版本,我自行安装。

谢谢。

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文章 Jingwei Wang · 一月 19, 2023 6m read

Python 已成为世界上使用最广泛的编程语言(来源:https://www.tiobe.com/tiobe-index/),SQL 作为数据库语言继续引领潮流。 Python 和 SQL 一起工作以提供 SQL 单独无法提供的新功能不是很好吗?毕竟,Python 拥有超过 380,000 个已发布的库(来源:https://pypi.org/),它们具有非常有趣的功能,可以在 Python 中扩展您的 SQL 查询。本文详细介绍了如何使用嵌入式 Python 在 InterSystems IRIS 数据库中创建新的 SQL 存储过程。

用作示例的 Python 库

本文将使用两个非常有用的库:Geopy 和 Chronyk。

Geopy 是一个用于将地理编码(地址和地理坐标的限定)应用于地址数据的库。有了它,就可以从街道名称中获取邮局格式的邮政编码和完整地址。非常有用,因为许多记录都有地址。

Chronyk 用于使用人类语言处理日期和时间。这非常有用,因为在内部,对于 IRIS 和 Python,日期是一个数字,表示自初始日期以来经过的时间量。对于人类来说,日期是 7 月 20 日,或者昨天,或者明天,或者两个小时前。 Chronyk 接受接收这样的日期,然后将其转换为通用日期格式。

InterSystems IRIS 中的 Python 支持

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文章 Lilian Huang · 一月 19, 2023 4m read

动机

这个项目是在我考虑如何通过Embedded Python让Python代码自然地处理IRIS globals所提供的可扩展的存储和高效的检索机制时想到的。

我最初的想法是使用globals创建一种Python字典的实现,但很快我就意识到,我应该首先处理对象的抽象问题。

所以,我开始创建一些可以包装Python对象的Python类,在globals中存储和检索它们的数据,也就是说,在IRIS globals中序列化和反序列化Python对象。

它是如何工作的?

像 ObjectScript 的%DispatchGetProperty()%DispatchSetProperty() 和%DispatchMethod()一样, Python 有委托对象的属性和方法调用的方式。

当你设置或获取一个对象属性时,Python 解释器让你通过方式 __setattr__(self, name, value) 和 __getattr(self, name)__来截获这个操作。

请看这个相当基本的例子。

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