
在本节中,我们将探讨如何在 IRIS 中使用 Python 作为主要编程语言,在使用 Python 编写应用程序逻辑的同时仍能利用 IRIS 的强大功能。

在本节中,我们将探讨如何在 IRIS 中使用 Python 作为主要编程语言,在使用 Python 编写应用程序逻辑的同时仍能利用 IRIS 的强大功能。
IRIS 支持开箱即用的 CCDA 和 FHIR 转换,但访问和查看这些功能需要大量的时间设置和产品知识。IRIS Interop DevTools 应用程序旨在弥补这一差距,让实施人员能够立即进入并查看产品的内置转换功能。
除了 IRIS XML、XPath 和 CCDA 转换环境,Interop DevTools 软件包现在还提供:
已经更新仪表板的外观和感触,看起来更加直观和用户友好。在 IRIS 中执行,以便充分利用环境,同时用户界面允许可见性、可重复性以及隔离修改和模块进行测试的能力。
以下是5个功能支持:
1. XPath 评估器: 根据输入 CCD 评估 XPath 并返回结果
2. CCDA 到 SDA 转换: 通过选定的基本 XSL 转换运行输入的 CCD,并显示 SDA 结果。
3. XSL 模板测试器: 针对输入 CCD 应用单个 XSL 模板,并显示生成的 CCD。
4. FHIR 到 SDA 转换: 在输入的 FHIR 资源或捆绑包上运行标准的 FHIR 到 SDA 转换,并显示 SDA 结果或 FHIR 验证错误响应。
5. 5. SDA 到 FHIR 转换: 在输入的 SDA 消息上运行标准的 SDA 到 FHIR 转换,并显示 FHIR 束结果。
基于 XSLT 的互联互通临床文档到 FHIR 资源转换
国家卫健委互联互通成熟度评测中的临床共享文档,作为医疗信息交换的重要载体,采用了XML标准的文档格式。随着医疗信息化的发展,FHIR(Fast Healthcare Interoperability Resources)作为新一代医疗信息交换标准,因其简洁性、灵活性和RESTful架构,逐渐成为医疗数据交换的理想选择。将共享文档文档转换为FHIR资源,能够有效促进不同医疗系统间的数据互通,提升医疗信息的利用价值。
XSLT(可扩展样式表语言转换)是一种用于将XML文档转换为其他XML文档或文本格式的语言。在医疗数据转换场景中,XSLT凭借其强大的XML处理能力,成为共享文档到FHIR转换的理想工具。
我们知道共享文档文档是一种结构化的XML文档,通常包含以下主要部分:
- 文档头(Document Header):包含文档元数据,如文档类型、创建时间、作者等
- 临床数据部分(Clinical Sections):按章节组织的临床信息,如问题列表、用药记录、检查报告等
- 数据条目(Entries):具体的临床数据项,如诊断、药物、检验结果等
FHIR则采用了资源导向的设计理念,每个临床概念都被建模为独立的资源,通过RESTful API进行访问。FHIR资源具有以下特点:
本演示程序用于展示如何采用自定义FHIR profile来验证数据合规性。自定义FHIR实施指南基于FHIR R4版本开发,在本例中实现了对Organization资源的扩展并用于验证数据的合规性。
想象一下那个场景。您正在 Widgets Direct 愉快地工作,这是互联网上首屈一指的小部件和小部件配件零售商。您的老板有一些毁灭性的消息,一些客户可能对他们的小部件不太满意,我们需要一个帮助台应用程序来跟踪这些投诉。为了让事情变得有趣,他希望代码占用非常小,并挑战您使用 InterSystems IRIS 以少于 150 行代码交付应用程序。这可能吗?
免责声明:本文记录了一个非常基本的应用程序的构建,为了简洁起见,省略了安全性和错误处理等细节。该应用程序仅供参考,不得用于任何生产应用。本文使用IRIS 2023.1作为数据平台,并非所描述的所有功能在早期版本中都可用
我们首先定义一个新的干净的命名空间 - 带有代码和数据数据库。虽然所有内容都可以位于 1 个数据库中,但将它们拆分以便于数据刷新。
我们的帮助台系统需要 3 个基本类:一个 Ticket 对象,它可以包含用于记录员工顾问 UserAccount 和客户联系人 UserAccount 之间交互的操作。让我们用一些基本属性来定义它们:
这篇文章介绍了使用由支持 langchain 框架的IRIS来实现问答聊天机器人,其重点介绍了检索增强生成(RAG)。
文章探讨了IRIS中的向量搜索如何在langchain-iris中完成数据的存储、检索和语义搜索,从而实现对用户查询的精确、快速的响应。通过无缝集成以及索引和检索/生成等流程,由IRIS驱动的RAG应用程序使InterSystems开发者能够利用GenAI系统的能力。
为了帮助读者巩固这些概念,文章提供了Jupyter notebook和一个完整的问答聊天机器人应用程序,以供参考。
什么是RAG以及它在问答聊天机器人中的角色
RAG,即检索增强生成,是一种通过整合超出初始训练集的补充数据来丰富语言模型(LLM)知识库的技术。尽管LLM在跨不同主题进行推理方面具有能力,但它们仅限于在特定截止日期之前训练的公共数据。为了使AI应用程序能够有效处理私有或更近期的数据,RAG通过按需补充特定信息来增强模型的知识。这是一种替代微调LLM的方法,微调可能会很昂贵。
在问答聊天机器人领域,RAG在处理非结构化数据查询中发挥着关键作用,包括两个主要组成部分:索引和检索/生成。
索引从数据源摄取数据开始,然后将其分割成更小、更易于管理的块以进行高效处理。这些分割的块随后被存储和索引,通常使用嵌入模型和向量数据库,确保在运行时能够快速准确地检索。
最近几个月,大型语言模型GPT正在激起一些现象。因此,上周末我不可避免地也在玩 ChatGPT,以探究它是否会成为我正在敲打的一些基于 BERT 的“传统”AI 聊天机器人的补充,或者更确切地说,它是否会淘汰它们。
玩的时候脑子里冒出一个念头。通过略微理论化或哲学化,最终互操作性标准(如 HL7 和 FHIR 等)是一种“语言”,对吗? HL7 有自己的语法、规则、词汇甚至方言——每个系统都有自己的语调。这就是为什么当一台机器与另一台机器对话时,它们需要翻译器(例如 DTL 转换)来实现相互理解。
所以环顾四周,似乎一切都是语言:编码是语言:python,javascript和COS也是语言。 HL7、FHIR 甚至 XML 或 JSON 都是语言,只是它们比自然语言更结构化,那么 GPT 应该更容易上手吗?
那么,我们可以从简单地重用 GPT 的预训练编码语言模型来模拟 DTL 开始吗?我们还没有进行调整,以下是初步结果:
输入:
前言
自接触IRIS以来在医院之中使用最多的是其作为一个ESB集成引擎来使用,作为医院的集成平台+数据中心中的一环。但是其也可以进行CRUD作为前后端分离项目的后端使用:
文章目录
前言
文章目录
一、开发技术和工具
二、开发路径和相关代码
1.数据库
2.准备工作
3.开发接口的相关步骤
4.成果展示
总结
本文章将以一个简单的页面展示IRIS的相关CRUD操作:
是的,我计划使用IRIS重构Production页面,先展示一下我开发完的成果吧:
呃の好像是一毛一样,哈哈
一、开发技术和工具
工欲善其事,比先利其器:
后端:HealthConnect+Global
前端:vue
使用IRIS的%CSP.REST开发的Rest API接口,前端使用vue简单的把接口相关内容展示,可以编辑、新增组件,控制production启动、停止、更新检测状态。
二、开发路径和相关代码
1.数据库
首先,我们找到Production的相关表,分别是:Ens_Config.Item 和 Ens_Config.Production 如图所示:
所以代码的思路很明确了对Ens_Config.Item进行新增、删除、修改、查询操作对Ens_Config.Production进行查询操作。
2.准备工作
在正式开发之前我们得先做一些准备工作:比如开放网关
日常工作中,JSON使用越来越多,很多其他的语言里面有成熟的JSON API,但cache 我一直没找到。而同事们使用的基本都是自己写的一些JSON工具。这些小工具,多多少少有些局限。使用ensemble2016后,发现了Ens.Util.JSON类,他可以处理JSON。翻阅代码后,实际上主要API是 %ZEN.Auxiliary.abstractController。在使用中,我们遇到一个问题,那就是有些JSON的节点名是带有下划线的,这个不太好处理。一般来说,我们把对象转为xml的时候,对象的属性我们是去掉下划线的,带下划线的名字是用 XMLNAME来设置的,于是考虑JSON里面也使用它(如果配置了)作为对象转JSON的时候,JSON的名字。修改 %ZEN.Auxiliary.jsonProvider的 %WriteJSONStreamFromObject方法后,发现ensemble的一些自带的页面的功能受到了影响。因此重新建立了一个副本。这里假定为 Util.JSON Extends %ZEN.Auxiliary.abstractController [ System = 3 ]。对象转为JSON的方法中,需要修改 ClassMethod %ObjectToJSON(pObject As %RegisteredObject, ByRef pVisited, pLevel
如果你读了我之前介绍QEWD微服务的文章,希望你会渴望了解如何使用它们。 所以在这篇文章中,我将解释你需要知道的东西,以便开始使用。
如果你在QEWD资源库中,你会发现目录:
https://github.com/robtweed/qewd/blob/master/example/jwt
在我之前关于JSON网络令牌(JWTs)和QEWD的文章中,我用这个示例应用程序来解释如何使用JWTs。 这个示例应用程序还演示了如何设置一个简单的微服务,在这种情况下是一个处理用户认证的服务。 所以,现在让我深入了解一下这个例子应用程序的这方面内容。
如果你想使用QEWD微服务,你也必须使用JWTs--它们提供了一种方法,用户的认证和会话可以被多个独立的QEWD服务器交叉通信和处理。 因此,请看一下启动文件:
https://github.com/robtweed/qewd/blob/master/example/jwt/startup_file/q…
你会看到,它将QEWD配置为使用JWT,并定义了用于签署和加密JWT的加密字符串:
jwt: {
secret: 'someSecret123'
},
而且,你可以看到如何定义微服务:
我一直希望 VSCode 能够拥有熟悉的 Studio 外观。
值得庆幸的是,VSCode 易于定制,因此您可以为任何元素选择任何颜色。
这是我到目前为止得到的:
%JSON快速参考本节提供本章中讨论的%JSON方法、属性和参数的快速参考。
%JSON.Adaptor方法这些方法提供了从JSON序列化和序列化到JSON的能力。
%JSON.Adaptor.%JSONExport()将启用JSON的类序列化为JSON文档,并将其写入当前设备。
method %JSONExport(%mappingName As %String = "") as %Status
%mappingName(可选)-要用于导出的映射的名称。基本映射由"" 表示,并且是默认映射。%JSON.Adaptor.%JSONExportToStream()将启用`JSON的类序列化为JSON文档并将其写入流。
method %JSONExportToStream(ByRef export As %Stream.Object,
%mappingName As %String = "") as %Status
export - 包含序列化的JSON文档的导出流。%mappingName(可选)-要用于导出的映射的名称。基本映射由""表示,并且是默认映射。JSON适配器是一种将ObjectScript对象(registered, serial or persistent)映射到JSON文本或动态实体的方法。本章涵盖以下主题:
JSON的对象并演示%JSON.Adaptor导入和导出方法JSON字段的属性参数。JSON-演示如何使用%JSON.ForMatter格式化JSON字符串。%JSON快速参考-提供本章中讨论的每个%JSON类成员的简要说明。从JSON序列化或序列化到JSON的任何类都需要子类%JSON.Adaptor,它包括以下方法:
%JSONExport()将启用JSON的类序列化为JSON文档,并将其写入当前设备。%JSONExportToStream()将启用JSON的类序列化为JSON文档并将其写入流。%JSONExportToString()将启用JSON的类序列化为JSON文档并将其作为字符串返回。%JSONImport()将JSON作为字符串或流导入,或者作为%DynamicAbstractObject的子类导入,并返回启用JSON的类的实例。之所以称为Dynamic,是说这个对象在代码编译的时候可以不定义对象的属性和结构,在runtime时才根据装入的数据来产生对象定义。IRIS里用Dynamic Object来处理JSON数据。简单说: 先定义一个Dynamic Object, 把JSON数据装进去,然后用对象的方式处理JSON文档。
让我们看看是它是怎么工作的。
创建一个Dynamic Object很简单, 标准而且啰嗦的写法是:
set dynObject1 = ##class(%DynamicObject).%New()
大家通常用简单的写法,像这样用一个{}来定义Dynamic Object:
DEMO>set dynObject1 = {}
DEMO>zw dynObject1
dynObject1={} ; <DYNAMIC OBJECT>
把JSON数据从字符串或者流导入DynamicObject被称作Deserializing;反之,把DynamicObject里的JSON导出来到String或者Stream叫Serializing。在类%DynmicObject中用的是%FromJSON()和%ToJSON()两个方法,一个是类方法,一个是实例方法:
我对EnsLib.HTTP.GenericOperation类进行了操作。此操作发送以下json消息:
<HTTPMessage xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" xmlns:s="http://www.w3.org/2001/XMLSchema">
<Stream>
假设您想编写一些真正的web应用程序,例如medium.com网站的简单克隆。这类应用程序可以在后端使用任何不同的语言编写,也可以使用前端的任何框架编写。编写这样一个应用程序有很多方法,你也可以看看这个项目。它为完全相同的应用程序提供了一堆前端和后端实现。您可以轻松组合它们,任何所选前端应该与任何后端搭配。
我来介绍一下这个使用后端InterSystems IRIS来实现后端的相同的应用程序。
最近我一直在发布对 JSON 功能的一些更新,我很高兴许多人提供了反馈。 今天,我想将重点放在另一个方面:使用 SQL 查询生成 JSON。